よく混同されますが、将棋は「指す」、囲碁は「打つ」とするのが普通です。三省堂国語辞典では、将棋は「指す」の項で「将棋の駒を＜動かす/動かして勝負する＞」、囲碁は「打つ」の項で「碁石を碁盤に置いて勝ち負けを争う」と説明されています。
「碁打ち」「将棋指し」という言葉もあります。
将棋で「打つ」を使う場合
ただ、将棋で「打つ」を使う時もあります。それは「相手から取った駒を盤に置く」（三省堂国語辞典）場合。「打ち歩詰め」というのは持ち駒の歩を打って相手の玉を詰ませる反則です。
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囲碁で「指す」の用例
囲碁でも、辞書をみると「指す」の用例がありました。
日本国語大辞典の「さす」の項には「碁で、石を置く。また、将棋などで駒を動かす」とあり、「碁打ちはてて、けちさすわたり」（源氏物語 空蟬）、「纔（わづかに）生きたる石は結（けち）に差ままに、手重く不擲（うた）ねども」（今昔物語巻24 碁擲寛蓮値碁擲女語第六＝ごうちのかんれん、ごうちのおんなにあうことだいろく）と、「けちさす」「結に差」という使い方で平安時代の用例が出ています。
「結（けち）」とは「囲碁の終盤戦で、まだ決まらない目を詰め寄せること」（日本国語大辞典）で、現在なら「ヨセ」というところでしょうか。
「碁打ちはてて（碁を打ち終わって）」「不擲ねども（打ちもしないのに）」と、「打つ」という言葉と一緒に出てくることから、平安時代には「けち」の時には「さす」が使われたのかなと想像します。
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